Francesca a commencé à naviguer dans sa ville natale de Trieste, en Italie, en 1999. Après avoir obtenu un diplôme en sciences du sport à l'Institut nautique de Trieste et à l'université San Raffaele, elle s'est engagée dans l'armée de l'air italienne où elle a servi en tant que premier officier de l'air.
Navigatrice très polyvalente, elle a représenté l'Italie lors des Jeux Olympiques de Londres et de Rio de Janeiro, a effectué deux tours du monde, devenant ainsi la première Italienne à remporter, lors de l'édition 2022-23, la 50e édition de The Ocean Race. En 2024, elle a également représenté les États-Unis lors de la Coupe de l'America pour femmes. De 2024 à 2025, Francesca a été skipper de l’équipe UpWind by MerConcept, la toute première équipe entièrement féminine à prendre part au circuit des Ocean Fifty.
En mars 2025, Francesca Clapcich annonce qu'avec son sponsor principal 11th Hour Racing, elle lance sa candidature pour participer au Vendée Globe 2028. L’équipe de Francesca Clapcich utilisera sa campagne IMOCA, l'expérience de Francesca en tant qu'athlète professionnelle, ainsi que la course au large pour contribuer à lutter contre la discrimination et le changement climatique par l'éducation, le plaidoyer et l'action collective.
Pour cela, elle achète le bateau Malizia - Sea Explorer de Boris Herrmann, suite à la Transat Jacques Vabre 2025.
En attendant d'avoir son IMOCA, Francesca naviguera auprès de la Team Malizia sur les courses en équipage.